Чтобы настроить НДС в интернет-магазине нужно выполнить следующее:
- В настройках своих компаний указать ставку НДС;
- В налогах создать новую ставку;
Как указать ставку НДС для основной фирмы
Перейдите в CRM => Компании и выберете основную фирму вашего сайта. Перейдите в настройки и укажите НДС.

Как только вы укажите в основной компании ставку НДС, она будет действовать для всех приложений, в которых нужно передавать НДС. Больше не нужно в каждом приложении указывать ставку.
Как указать НДС для продаваемых товаров
Перейдите в Товары => Управление ценами => Налоги. У вас откроется таблица доступных налогов. Нажмите добавить. У вас откроется форма добавления ставки.

Укажите название, ставку, например, 7. Укажите входит ли она в цену товара или нет. Затем выберете код ставки, для связи в приложениях. Условия применения указывайте по необходимости. Активируйте ставку и сохраните.